Pierwszy krok to wejście na stronę www.krakow2016.com. Tam będzie zamieszczony specjalny formularz rejestracyjny w pięciu językach: polskim, angielskim, włoskim, francuskim i hiszpańskim. Rejestracja będzie przeprowadzona w dwóch etapach. Najpierw rejestrowane będą makrogrupy, czyli grupy do 5000 uczestników, skupiające się przy Diecezjalnym Centrum ŚDM. W drugim etapie będą one dzielone na podgrupy do 150 osób. Jedna podgrupa będzie mieć ten sam Pakiet Pielgrzyma i ten sam język katechezy. Makrogrupy zgłaszać będą Diecezjalne Centra ŚDM. Grupy zagraniczne organizują się zaś przy Konferencjach Episkopatów danego kraju, a wspólnoty międzynarodowe będą rejestrowane przez swoje centrale.

Do wyboru będą różne Pakiety Pielgrzyma np. pakiety na cały tydzień lub weekendowe. Trzeba będzie wybrać też wariant: wyżywienie i nocleg, wyżywienie bez noclegu, nocleg bez wyżywienia lub bez noclegu i bez wyżywienia. Zarejestrowani pielgrzymi będą ubezpieczeni na czas ŚDM. Otrzymają też plecak pielgrzyma, czyli zestaw materiałów informacyjno-religijnych pomagających w przeżywaniu wydarzeń centralnych, poruszaniu się po mieście itp. oraz gadżetów identyfikacyjnych. Koszt składki na te cele zostanie podany na oficjalnej stronie internetowej ŚDM wraz z uruchomieniem systemu.

Rejestracja ułatwia pracę organizatorom tego wielkiego wydarzenia ale jest też dla pielgrzymów gwarancją noclegu, sprawnego poruszania się po Krakowie i dostępu do miejsc wydarzeń, wyżywienia w czasie ŚDM oraz kompletu informacji potrzebnych do dobrego przeżycia ŚDM.

Uroczyste uruchomienie systemu rejestracji odbędzie się w niedzielę przy bazylice Mariackiej w Krakowie. O godz. 10 kard. Stanisław Dziwisz będzie przewodniczył Mszy Świętej o dobre owoce spotkania młodych. Następnie krakowski hejnalista zagra hymn Światowych Dni Młodzieży, a kard. Stanisław Dziwisz, razem z młodzieżą, uruchomi zegar odliczający 366 dni do ŚDM. Komitet Organizacyjny ŚDM ma nadzieję, że pierwszym zarejestrowanym będzie Papież Franciszek.