Rafał Czajkowski został zwolniony we wrześniu 2017 roku. o tym jak został zwolniony z zajmowanego stanowiska domagał się początkowo przywrócenia do pracy, a w trakcie procesu zmienił swoje żądanie na finansową rekompensatę.

- To tylko pokazuje, że argumenty, jakie miałem wypowiadając umowę o pracę poprzedniemu sekretarzowi były trafione. Na miejscu pana Rafała Czajkowskiego zakończyłbym ten spór. Pan Czajkowski na nową pracę - poza Urzędem Miejskim w Radomiu, a Urząd Miejski w Radomiu ma bardzo dobrego sekretarza, jakim jest pan Michał Michalski - mówi prezydent Radomia Radosław Witkowski:

Rafał Czajkowski będzie odwoływał się od wyroku do sądu wyższej instancji: 

Przypomnijmy, że Rafał Czajkowski przestał pełnić funkcję sekretarza miasta na początku września 2017 roku. Powodem decyzji prezydenta była utrata zaufania oraz naruszenie przez Rafała Czajkowskiego Kodeksu Etyki Pracowników Samorządowych obowiązującego w Urzędzie Miejskim w Radomiu. Chodziło o punkt 9 kodeksu mówiący o tym, że pracownik samorządowy „nie krytykuje publicznie swojego urzędu, decyzji przełożonych oraz osób i instytucji realizujących politykę i zadania samorządu terytorialnego”. Sprawa miała związek z oceną pracy Straży Miejskiej podczas obchodów rocznicy Radomskiego Czerwca, kiedy to został pobity jeden z ich uczestników.